肉制品中鸡肉源成分的Proofman-LMTIA方法检测

王博锐1,2,许丹丹1,2,谷蒙林2,3,姚蔚1,2,王耀1,肖付刚2,王德国2*

(1.河南科技大学 食品与生物工程学院,河南 洛阳 471000;2.许昌学院 食品与药学院河南省食品安全生物标识快检技术重点实验室,河南 许昌 461000;3.河南工业大学 粮油食品学院,河南 郑州 450001)

摘 要:为建立一种梯型熔解温度等温扩增技术(ladder-shape melting temperature isothermal amplification,LMTIA)结合Proofman 探针(proofreading enzyme-mediated probe cleavage)检测肉制品中的鸡肉,选取鸡细胞核中单拷贝且特异性强的prolactin receptor 基因为靶基因,设计LMTIA 引物和Proofman 探针,优化Proofman-LMTIA 反应体系,进行特异性、灵敏度和最低检测限测定。结果表明,Proofman-LMTIA 方法特异性强,可在30 min 内完成检测,检测灵敏度为1 ng/μL,对人工模拟的混合肉样的最低检测限为0.1%。该方法适用于基层单位对肉制品掺假进行快速检测。

关键词:Proofman 探针;梯型熔解温度等温扩增技术;肉制品;鸡肉;快速检测

肉类富含多种优质蛋白,可为人体提供多种必需氨基酸,从而提高人们的身体素质[1]。与其他肉类相比,牛肉和羊肉的价格更高,以致于有些不法商家以次充好、以假乱真,将便宜的鸡肉或鸭肉掺入到牛、羊肉中,赚取更高的利润[2-3]。这种行为严重损害了消费者的合法权益,扰乱了市场秩序,甚至可能会造成消费者产生过敏症状,从而危及生命[4]。因此,亟需开发一种快速、简便、稳定性好、实用性强的肉类掺假检测方法。

目前,国内外学者们开发了各种肉类掺假的检测方法,包括以蛋白质和DNA 分子为目标物的方法[5-6],此外,还可以根据肉类中的脂类、大分子糖类和酚类等代谢物质进行检测[7-9]。DNA 分子基于其热稳定性和高度保守性,在加工处理后仍可稳定存在,因此成为肉制品物种鉴定的主要方法[10-12]。目前,基于DNA 分子的主要鉴定方法包括实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)[13-15]、数字PCR[16-17]、环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[18-19]、重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA)[20-21]等。其中,PCR具有特异性强、灵敏度高、应用广泛等优点,但需要昂贵的设备和专业人员,不适用于基层单位的快速检测[22]。LAMP 和RPA 等核酸等温扩增技术具有快速、灵敏、操作简单等优点,但可能存在引物设计困难和假阳性等问题[23-24]。因此,需要开发一种快速、高效、操作简单、成本较低的新型检测技术以应对市场需求。

梯型熔解温度等温扩增技术(ladder-shape melting temperature isothermal amplification,LMTIA)是近两年发展起来的一种核酸等温扩增技术[25],该技术在反应时不需要温度的变化,反应全程只需要一个恒定的温度,还具有反应时间迅速、灵敏度高、针对的靶序列短等优点[26],因此在食品掺假检测[27-29]和病毒检测[30]等领域已得到成功应用。LMTIA 技术主要利用靶序列上的熔解温度差值来进行解链,而不依赖温度的变化及酶的作用,从而实现核酸的稳定扩增。Proofman 探针(proofreading enzyme-mediated probe cleavage)是一种新型探针[31],在其序列的两端分别标记荧光基团和淬灭基团,通过高保真酶的校正作用实现反应的实时监测。本研究将Proofman 探针与LMTIA 技术相结合,建立一种鸡肉源基因的快速检测方法,以期对肉制品中鸡肉源基因进行检测,为市场上肉制品掺假提供一种新的检测方法。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

鸡肉、鸭肉、猪肉、羊肉、牛肉、玉米淀粉、红薯淀粉、木薯淀粉、绿豆淀粉、小麦粉:市售。

血液/细胞/组织基因组DNA 提取试剂盒:天根生化科技(北京)有限公司;Nucleo Spin R Food 试剂盒:德国MACHEREY-NAGEL 公司;GPV8 超保真DNA 聚合酶:通用生物系统(安徽)有限公司;Bst II Pro DNA聚合酶大片段:南京诺唯赞生物科技股份有限公司;通用型LMTIA 反应预混液:德歌生物技术(山东)有限公司。

1.2 仪器与设备

Gentier 96E 全自动PCR 分析系统:西安天隆科技有限公司;Archimed X4 医用荧光定量PCR 仪:鲲鹏(徐州)科学仪器有限公司;F6/10 匀浆机:上海净信科技有限公司;1-15K 高速冷冻离心机:德国Sigma 公司;DH300 干式恒温器:杭州瑞诚仪器有限公司;Nano Drop One 超微量核酸蛋白测定仪:美国Thermo 公司。

1.3 方法

1.3.1 模拟样品的制备

所用样品均为去除表皮、脂肪和骨头后的新鲜肉块,使用匀浆机将肉块打成肉糜,置于-20 ℃保存备用。

参考Chen 等[32]的方法,称取0.1 g 鸡肉与99.9 g的牛肉,将二者混合,并向混合肉糜中加入不影响反应的有色染料,使用匀浆机将二者混合均匀,所制样品即为鸡肉质量分数为0.1%的模拟样品。按照该方法分别制备鸡肉质量分数为0%、0.1%、1.0%、5.0%、10.0%、20.0%、100.0%的混合样品,每组样品分别制作5 个平行样,所有样品置于-20 ℃备用。

1.3.2 DNA 提取

按照血液/细胞/组织基因组DNA 提取试剂盒操作说明提取各肉类基因组DNA 和1.3.1 制备的模拟肉样。按照Nucleo Spin R Food 试剂盒操作说明提取玉米淀粉、红薯淀粉、木薯淀粉、绿豆淀粉和小麦粉等植物淀粉的DNA。提取完成后,使用超微量核酸蛋白测定仪检测所提DNA 的浓度和纯度,确保A260/A280 比值在1.6~2.0 之间,以便进行LMTIA 扩增。将提取的DNA样品置于-20 ℃保存。

1.3.3 LMTIA 引物和Proofman 探针设计

根据GenBank 数据库上公布的鸡源基因,选取鸡细胞核中的高度保守序列prolactin receptor(GenBank ID:KU553470.1)为靶标,使用Oligo 7 软件分析所选序列,选取熔解温度曲线呈梯型且DNA 分子中GC 碱基含量在40%~60%的片段,以该片段为靶序列设计LMTIA 引物,而后根据所设计的LMTIA 环引物设计Proofman 探针。所设计的引物和探针均由通用生物系统(安徽)有限公司合成,序列见表1。

表1 LMTIA 引物及Proofman 探针序列
Table 1 Sequences of LMTIA primers and Proofman probe

引物名称引物序列(5′ - 3′)F 5′-CTCTCTTCCACAACTTTTTTATGGCTTGCCGCTTCTCC-3′B 5′-AAGTTGTGGAAGAGAGTTTTAGCAGAAGGACTTTTGGAGGG-3′LF5′-GGGTCTAGTTGGGCAG-3′LB5′-CAGAAGAACCCCCAC-3′Probe5′BHQ1-GGGTCTAGTTGGGCAA-FAM3′

1.3.4 反应温度优化

使用提取的鸡肉基因组DNA 作为阳性对照对所设计的LMTIA 引物和探针进行温度筛选,反应程序设置:温度区间为53、54、55、56 ℃,90 s 采集一次荧光信号,40 个循环,反应结束后观察并分析扩增结果,确定所建Proofman-LMTIA 方法的最适温度。

1.3.5 灵敏度测定

为确定所建立的Proofman-LMTIA 检测方法的灵敏度,将鸡肉基因组DNA 梯度稀释至10、1、0.1、0.01、0.001 ng/μL,以优化好的反应体系进行检测。由于样品新鲜度、人为因素误差和DNA 降解等原因可能会对检测结果产生一定的影响,为保证检测结果具有可重复性,每组试验重复进行5 次以验证方法的准确性。

1.3.6 特异性测定

为验证所建方法能否区分不同肉类及肉类中可能掺入的淀粉类制品,以1.3.2 中提取的猪肉、鸭肉、牛肉、羊肉、玉米淀粉、红薯淀粉、木薯淀粉、绿豆淀粉、小麦粉等基因组DNA 作为对照,H2O 为阴性对照、鸡肉基因组DNA 为阳性对照,以优化的反应体系进行测试,观察并分析测试结果。每组试验重复进行5 次以保证方法的准确性。

1.3.7 模拟样品检测限测定

为验证所建方法的最低检测限,制备混合模拟肉样,配制LMTIA 反应体系,将制备的鸡肉质量分数为0%、0.1%、1.0%、5.0%、10.0%、20.0%、100.0%的模拟样品DNA 进行测试,试验结束后观察并分析结果。每组试验重复进行5 次以保证方法的准确性。

1.4 数据处理

使用Gentier 96E 全自动医用PCR 分析系统(V1)和Archimed Analyzer 实时荧光定量PCR 仪软件(v1.4.4)对检测结果和扩增曲线进行分析,再使用Excel、PowerPoint 软件对结果和扩增图进行分析处理。

2 结果与分析

2.1 检测原理

基于Proofman 探针的LMTIA 方法检测鸡肉源基因的原理如图1 所示。

图1 Proofman 探针原理
Fig.1 Proofman probe principle diagram

Proofman 探针根据LMTIA 的环引物所设计,如图1 所示,标记荧光基团的错配碱基设计Proofman 探针的3′端,Proofman 探针的5′端设计一个淬灭基团。反应未开始时,3′端荧光基团发出的荧光被5′端淬灭基团所吸收,故反应无荧光信号产生。反应开始时,Proofman 探针的3′端错配碱基被超保真DNA 聚合酶切除,荧光基团被释放,仪器通过采集产生的荧光信号实现对目标物质的实时监测。

2.2 反应温度优化结果

图2 为Proofman-LMTIA 的温度优化结果。

图2 Proofman-LMTIA 温度优化结果
Fig.2 Proofman-LMTIA reaction temperature optimization

由图2 所示,在反应温度为53、54、55、56 ℃时,只有鸡肉基因组DNA 出现扩增反应,阴性对照未扩增。反应温度为54 ℃时,扩增效率和重复性都比较好,所以选择54 ℃作为所建方法的最适温度。

2.3 灵敏度测试结果

Proofman-LMTIA 灵敏度检测结果如图3 所示。

图3 Proofman-LMTIA 灵敏度结果
Fig.3 Sensitivity determination of Proofman-LMTIA assay

由图3 可知,在反应温度54 ℃,反应进行40 循环时,梯度稀释的10 ng/μL 和1 ng/μL 的鸡肉基因组DNA 出现扩增,而0.1、0.01、0.001 ng/μL 和阴性对照均未出现扩增。说明该方法能检测到DNA 质量浓度为1 ng/μL 的样品,即Proofman-LMTIA 方法的灵敏度为1 ng/μL。

2.4 特异性结果分析

Proofman-LMTIA 特异性检测结果如图4 所示。

图4 Proofman-LMTIA 特异性结果
Fig.4 Specificity determination of the Proofman-LMTIA assay

由图4 可知,在反应进行到40 循环时,只有加入的鸡基因组DNA 出现扩增,而阴性对照及其它物种DNA 均未出现扩增。说明所建方法的特异性较强,与其他物种无交叉反应,能够特异区分鸡源基因和其它物种DNA,能够对肉制品中鸡肉源基因掺假进行检测。

2.5 模拟样品检测限测试结果

鸡肉模拟样品Proofman-LMTIA 方法检测限测试结果如图5 所示。

图5 Proofman-LMTIA 模拟肉样结果
Fig.5 Simulated meat sample results of Proofman-LMTIA

1~6.鸡肉质量分数分别为100.0%、20.0%、10.0%、5.0%、1.0%、0.1%的混合肉样;7.阴性对照及鸡肉质量分数为0%的混合肉样。

由图5 可知,在54 ℃反应的40 循环内,阴性对照及鸡肉质量分数为0%的肉样未出现扩增,鸡肉质量分数为0.1%、1.0%、5.0%、10.0%、20.0%、100.0%的混合模拟样品均在20 循环内出现扩增。因此,该方法能够在30 min 内检测出鸡肉含量为0.1%及以上的样品,即可检测出1 000 kg 肉制品中掺入1 kg 鸡肉。

3 结论

本研究建立了一种用于快速检测肉制品中鸡肉成分的Proofman-LMTIA 检测方法。选取鸡细胞核中单拷贝且特异性强的prolactin receptor 基因为靶序列设计引物及Proofman 探针。通过对反应体系的优化,在反应温度为54 ℃时对鸡肉基因组DNA 的检测灵敏度为1 ng/μL,与所测试的肉制品中常见的可掺假物种无交叉反应,可在30 min 内检测出肉制品中掺入的0.1%及以上的鸡肉,为检测肉制品中鸡肉掺假提供了一个快速、准确的方法,该方法操作简单、灵敏度高、特异性强、反应时间短、适用范围广,为规范肉制品市场秩序提供技术支持。

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Proofman-LMTIA for Detection of Chicken-Derived Components in Meat Products

WANG Borui1,2,XU Dandan1,2,GU Menglin2,3,YAO Wei1,2,WANG Yao1,XIAO Fugang2,WANG Deguo2*
(1.College of Food and Bioengineering,Henan University of Science and Technology,Luoyang 471000,Henan,China;2.Key Laboratory of Biomarker Based Rapid-detection Technology for Food Safety of Henan Province,College of Food and Pharmacy,Xuchang University,Xuchang 461000,Henan,China;3.College of Grain and Food,Henan University of Technology,Zhengzhou 450001,Henan,China)

Abstract:A proofreading enzyme-mediated probe cleavage combined with ladder-shape melting temperature isothermal amplification(Proofman-LMTIA)method was established for the detection of chicken-derived components in meat products.The specific single-copy nuclear prolactin receptor gene of chicken was selected as the target gene for the design of LMTIA primers and Proofman.The LMTIA system was optimized,and then the specificity,sensitivity,and limit of detection (LOD)of the established method were evaluated.The results showed that the established method realized complete amplification within 30 min with high specificity and demonstrated the sensitivity of 1 ng/μL and the LOD of 0.1% for artificially adulterated meat samples.The Proofman-LMTIA method established in this study is suitable for primary organizations to quickly detect adulterants of meat products.

Key words:proofreading enzyme-mediated probe cleavage;ladder-shape melting temperature isothermal amplification;meat product;chicken;rapid detection

DOI:10.12161/j.issn.1005-6521.2023.16.023

基金项目:国家自然科学基金项目(31701689、32172300);河南省科技攻关项目(212102110214);河南省高校重点研发项目(21B550006)

作者简介:王博锐(1997—),男(汉),硕士研究生,研究方向:食品质量与安全快速检测。

*通信作者:王德国(1975—),男(汉),教授,博士,研究方向:食品质量与安全快速检测。

引文格式:

王博锐,许丹丹,谷蒙林,等.肉制品中鸡肉源成分的Proofman-LMTIA 方法检测[J].食品研究与开发,2023,44(16):162-166.

WANG Borui,XU Dandan,GU Menglin,et al.Proofman-LMTIA for Detection of Chicken-Derived Components in Meat Products[J].Food Research and Development,2023,44(16):162-166.

加工编辑:张昱

收稿日期:2022-12-15