虹鳟肌肉中蛋白含量、脂肪含量以及必需氨基酸含量均高于青鱼、草鱼、鲢鱼等几种常见的淡水鱼[1-2],其骨中蛋白质和脂肪含量分别为20.69%和22.8%,不饱和脂肪酸含量为83.54%,均高于一般鱼类[3],所以虹鳟的需求量及产量都与日俱增;根据联合国粮农组织渔业统计数据, 从2008 年到2018 年全球虹鳟产量已从67.732 万吨增长到84.919 6 万吨; 就我国而言,2017 年我国冷水鱼产量在5 万吨左右, 其中虹鳟约占3.860 6 万吨[4]。作为美味又富有营养的食品而言,虹鳟食用方法很多,主要的商品有生鱼片、罐头、鱼糜、烟熏制品等,虹鳟鱼皮还可以用作胶原蛋白的提取[5]。由于部分商品在加工过程中形态学特征受到不同程度的破坏,通过商品形态无法对其是否源自虹鳟进行判别[6],所以常用核酸与蛋白质等方法对其真实性加以鉴别。 因蛋白质具有组织特异性且在食品加工过程中的高温、 高压以及高盐处理可能会使其发生变性,检测的准确性会受到影响[7]。 因此,基于核酸的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测方法成为目前用于水产品鉴别的主要方法。
实时荧光聚合酶链式反应(real-time fluorescence PCR,RT-PCR)检测在食品及鱼类产品中应用已较为广泛。 李秋阳等[8]对荧光定量PCR 检测在食品中的应用做了相应的介绍,方军等[9]利用实时荧光PCR 建立了对鱼翅这种加工要求较高的产品的检测方法,方法较为稳定可行;郭凤柳等[10]也开发了针对掺假肉类的PCR 检测方法;ZHAO 等[11]进行了以PCR-测流免疫分析法鉴定驴肉源性的研究;史莹莹等[12]建立了实时荧光定量PCR 鉴定肉制品中牛源性成分及其含量方法;罗建兴等[13]利用实时荧光定量PCR 法检测对食品中鹌鹑源性成分进行检测;汪艺等[14]对水产品中的鳕鱼建立了实时荧光定量聚合酶链式反应能快速鉴定3 种鳕鱼。 李进波等[15]用实时荧光PCR 法鉴定食品中鲑亚科鱼成分,并可用于市场上鲑科鱼及产品的检测。
本研究以虹鳟为研究对象,利用线粒体基因具有编码效率高、在不同区域进化速度存在差异和母性遗传等特点[16-17],针对虹鳟较其它鱼类在线粒体基因组上保守度相对较高的ATP6 设计特异性引物和探针[18-19],建立针对虹鳟源性成分的实时荧光PCR 检测技术,可用于检测市售的三文鱼产品是否含有虹鳟源性成分。
待检测样品: 市售的三文鱼片4 份和网购的虹鳟鱼籽、烟熏、烤制及虹鳟生鱼片等18 份,详见表1。
表1 待检测样品列表
Table 1 List of samples to be tested
样品编号市售名称物种标识来源产地1三文鱼刺身未标识市售智利2三文鱼刺身未标识市售智利3三文鱼刺身未标识市售英国4三虹文鱼刺身未标识市售5鳟鱼子酱虹鳟网购丹麦6水浸三文鱼罐头未标识网购7橄榄油浸三文鱼罐头 未标识网购8酱香三文鱼大西洋鲑网购丹麦9盐烤三文鱼大西洋鲑网购10大西洋鲑鱼片大西洋鲑网购英国11香草三文鱼未标识网购12三文鱼瘦肉大西洋鲑网购丹麦13黑椒三文鱼未标识网购14冷冻烟熏三文鱼片 大西洋鲑网购挪威15惠扬烟熏三文鱼片 大西洋鲑网购16烟熏三文鱼未标识网购中国17虹鳟鱼片虹鳟网购大西洋18盐水三文鱼罐头未标识网购挪威19济宁虹鳟虹鳟网购中国20延边虹鳟虹鳟网购中国21甘肃虹鳟虹鳟网购中国22烟熏三文鱼片未标识网购中国
10 份虹鳟鱼样品: 青海民泽龙羊峡公司提供;带鱼、大黄鱼、中国芦花、尼罗罗非鱼、草鱼、鲅鱼、大眼鳜、鲫鱼、石斑、蓝鳍金枪鱼、黄鳍金枪鱼、大目金枪鱼、长鳍金枪鱼、锦鲤、大西洋鲑、多宝鱼、鲳鱼17 种非靶标鱼样品:市售。
动物组织基因组提取试剂盒:天根生化科技有限公司;引物和探针:由生工生物工程(上海)有限公司合成。
LightCycler R 480 II 实时荧光定量PCR: 美国Roche 公司;3K15 台式高速冷冻离心机: 曦玛离心机(扬州)有限公司;HH-S3 数显恒温水浴锅:金坛市金南仪器制造有限公司。
1.3.1 样品的制备
取0.1 g 样品,加入600 μL 去离子水,在5 000 r/min条件下匀浆40 s。
1.3.2 DNA 的提取
将分别匀浆后的样品,在6 000 r/min 条件下离心1 min,弃上清液留沉淀,使用动物组织基因组提取试剂盒进行样品DNA 的提取,作为PCR 扩增的模板。
特异性试验样品准备:用青海民泽龙羊峡公司提供的10 份虹鳟鱼样品和本研究中收集的其它17 个非靶标鱼类组织提取的DNA 来研究该方法的特异性。选取不同虹鳟鱼的DNA 样品10 份,经DNA 条形码技术验证后的带鱼、大黄鱼、中国芦花、秋刀鱼、尼罗罗非鱼、草鱼、鲅鱼、大眼鳜、石斑、蓝鳍金枪鱼、黄鳍金枪鱼、大目金枪鱼、长鳍金枪鱼、比目鱼、鲤鱼、大西洋鲑鱼、鲫鱼DNA 样品各1 份备用。
DNA 灵敏度试验样品准备:选取青海民泽龙羊峡公司提供的虹鳟鱼样品的DNA,原始浓度为50 ng/μL,用去离子水分别稀释为10、1、0.1、0.01、0.001ng/μL 备用,其中50、10、1、0.1 ng/μL 每个浓度做4 次重复试验;0.01、0.001 ng/μL 做8 次重复试验验证。
1.3.3 引物设计和选择
从NCBI 数据库中下载虹鳟、 大西洋鲑、 大马哈鱼、帝鲑、石斑、带鱼等25 种线粒体基因组全序列,利用Geneious Prime 2019 版对序列进行比对分析, 比对结果表明ATP6 基因在虹鳟中具有一定的保守性,利用软件Primer Premier 5.0 设计引物。 引物和探针序列如表2 所示。
表2 虹鳟引物及探针
Table 2 Primers and probes for Oncorhynchus mykis
引物、探针序列ATP6-FGTCCCACTGTGGCTTGCT ATP6-RGGGTTCCTTCAGGCAATAA ProbeACAGTAATTATCGGCATACG FISHTCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC FISHTAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA
利用DNA 条形码技术对样品进行验证[20-22],对收到样品进行针对线粒体COX I 基因的部分特异区段的通用(>99%)引物FISH F/R[23]测序,测序结果在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)进行序列比对,选取相似度最高的结果进行系统进化树的构建。
1.3.4 PCR 扩增
实时荧光PCR 反应体系为20 μL ∶0.2 μL 的TaKaRa Ex Taq HS(5 U/μL),4 μL 的10×Ex Taq Buffer,3 μL的dNTP 混合液(2.5 mmol/L),0.4 μL 的ATP6-F(10 μmol/L),0.4 μL 的ATP6-R (10 μmol/L),0.6 μL 的Probe(10 μmol/L),9.4 μL 的无菌水,2 μL 的DNA。
参照LightCycler480 II 实时荧光PCR 仪使用说明书及TAKARA 公司TaKaRa Ex Taq R Hot Start Version推荐的反应程序,设置反应程序:95 ℃预变性30 s,1 个循环;95 ℃变性10 s,60 ℃退火延伸30 s,40 个循环;40 ℃冷却30 s,1 个循环。
利用DNA 条形码技术验证收集样品真实性和准确性的结果如图1 和表3 所示。 本研究所收集样品和NCBI 数据库序列比对相似度达99.9%。
表3 18 种鱼类样品名称及测序结果
Table 3 Names and sequencing results of 18 fish samples
样品编号 市售名称检测结果是否与市售名称一致A1带鱼NC_018791.1(Trichiurus lepturus)是A2大黄鱼NC_011710.1(larimichthys crocea)是A3 中国芦花NC_018045.1(Lateolabrax maculatus)是A4秋刀鱼NC_003183.1(Cololabis saira)是A5 尼罗罗非鱼NC_013663.1(Oreochromis niloticus)是A6草鱼NC_010288.1(Ctenopharyngodon idella)是A7鲅鱼NC_016420.1(Scomberomorus niphonius)是A8大眼鳜NC_015987.1(Siniperca knerii)是A9石斑NC_020046.1(Epinephelus fuscoguttatus)是B1 蓝鳍金枪鱼NC_014052.1(Thunnus thynnus)是B2 黄鳍金枪鱼NC_014061.1(Thunnus albacores)是B3 大眼金枪鱼NC_014059.1(Thunnus obesus)是B4 长鳍金枪鱼NC_005317.1(Thunnus alalunga)是B5 青海虹鳟鱼KP013084(Oncorhynchus mykiss)是B6比目鱼NC_002386.1(Sphingomonas ginsengisoli)是B7鲤鱼NC_018037.1(Cyprinuscarpiohaematopterus)是B8 大西洋鲑NC_001960.1(Salmo salar)是B9鲫鱼KU896992(Carassius gibelio isolate)是
图1 18 份样品的线粒体上COX I 的最大似然法和邻接法分子进化树
Fig.1 The maximum likelihood and neighbor joining molecular evolutionary trees of COX I on the mitochondria of 18 samples
选取青海不同虹鳟养殖场的虹鳟10 份,市售不同种类的鱼17 份,用引物ATP6-F/R 进行PCR 扩增,结果如图2 所示。
图2 虹鳟源性成分检测的特异性试验
Fig.2 Specific detection of rainbow trout-origin components
在32 个循环之前只对虹鳟进行了扩增, 对其它(大西洋鲑鱼、带鱼、大黄鱼、中国芦花、秋刀鱼、尼罗罗非鱼、草鱼、鲅鱼、大眼鳜、石斑、蓝鳍金枪鱼、黄鳍金枪鱼、大目金枪鱼、长鳍金枪鱼、比目鱼、锦鲤、鲫鱼)17种鱼、空白对照未见扩增曲线,说明该方法特异性良好,可用于虹鳟源性的样品的检测判定值为32 个循环,在32 个循环之前出现明显扩增曲线的,判定为阳性;在32 个循环之前未出现明显扩增曲线的,判定为阴性。
验证TaqMan 探针方法的DNA 灵敏度结果如图3 所示。
由图3 可知,在这6 个浓度梯中50、10、1、0.1 ng/μL在32 个循环前有扩增,0.01、0.001 ng/μL 在32 个循环之前无扩增,表明本方法的灵敏度为0.1 ng/μL。
图3 DNA 浓度灵敏度试验
Fig.3 Sensitivity of different DNA concentration
对表1 中1 号~22 号样品的检测结果如图4 所示。
由图4 可知,2 份市售三文鱼生鱼片和8 份网购的三文鱼及制品在32 个循环之前出现明显扩增曲线,判定为阳性即检出虹鳟源性成分, 另外2 份市售三文鱼生鱼片和10 份网购的三文鱼及制品在循环之前未出现明显扩增曲线的,判定为阴性即未检出虹鳟源性成分;对扩增结果进行测序分析,测序结果与测试结果一致。
图4 市售样品检测的DNA 扩增谱图
Fig.4 DNA amplification profile of commercially available samples
本研究首先对收集的样品用线粒体COX I 基因的部分特异区段设计的引物FISH F/R 进行扩增测序,验证了收集样品的真实性;进而通过设计虹鳟特异性的引物探针, 建立了针对虹鳟源性成分的实时荧光PCR 检测方法,利用17 种市场常见鱼类进行检测,结果表明本方法特异性良好,并根据试验数据设定32 个循环以后出峰的是未检出样品,为阴性;经DNA 梯度稀释验证本方法的灵敏度为0.1 ng/μL, 对市售22 份标有鲑科鱼源性成分的样品进行测试,表明本方法可用于对市售产品中虹鳟源性成分的鉴别,同时也表明虹鳟是市售三文鱼的主要鱼种之一。
[1] FRANCESCO A,MARIA CRISTIAN G,MARRIA L,et al.Anatomical, histological and immunohistochemical study of the tongue in the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)[J]. Anatomia, Histologia,Embryologia,2020,49(6):848-858.
[2] 赵楠,李学科,张春晖,等.虹鳟鱼骨营养成分分析[J].中国食品添加剂,2016(1):141-146.ZHAO Nan, LI Xueke, ZHANG Chunhui, et al. Nutritional components of trout bone[J].China Food Additives,2016(1):141-146.
[3] 宋苏祥,孙大江,范兆廷,等.虹鳟鱼肌肉营养成分的分析[J].大连水产学院学报,1996(1):70-73.SONG Suxiang, SUN Dajiang, FAN Zhaoting, et al. An analysis of the nutritive compositions in the muscle of rainbow trout[J].Journal of Dalian Fisheries University,1996(1):70-73.
[4] 佚名.青海冷水鱼产量占国内五分之一——“十三五”末将达到2 万吨[J].水产养殖,2017(3):37.ANON. Qinghai's cold-water fish production accounts for one fifth of China's total—By the end of the 13th five-year plan,it will reach 20,000 tons[J].Aquaculture Science,2017(3):37.
[5] 刘丛力,李娟,张双灵,等.虹鳟鱼皮营养成分及其胶提工艺探讨[J].食品研究与开发,2013,34(8):97-99.LIU Congli, LI Juan, ZHANG Shuangling, et al. Study of nutrition components and collagen-extracted on Oncorhynchus mikiss skin[J].Food Research and Development,2013,34(8):97-99.
[6] RASMUSSEN R T, MORRISSEY M T. Application of DNA-Based methods to identify fish and seafood substitution on the commercial market[J].Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety,2009,8(2):118-154.
[7] VAN RAAMSDONK L W D,VON HOLST C, BAETEN V. New developments in the detection and identi-fication of processed animal proteins in feeds[J].Animal Feed Science&Technology,2007,133(1):63-83.
[8] 李秋阳,姚瑶.实时荧光定量PCR 技术在食品检验中的应用[J].食品安全导刊,2018(15):130.LI Qiuyang,YAO Yao.Application of real-time fluorescent quantitative PCR in food inspection[J].China Food Safety Magazine,2018(15):130.
[9] 方军,林晨,张志军,等.实时荧光PCR 法在鱼翅鉴别中的应用[J].食品研究与开发,2017,38(24):132-136.FANG Jun,LIN Chen,ZHANG Zhijun,et al.Identification of shark fins with real-time PCR Method[J]. Food Research and Development,2017,38(24):132-136.
[10] 郭凤柳,熊蕊,刘晓慧,等.应用PCR 技术检测掺假肉类[J].食品安全质量检测学报,2014,5(2):541-545.GUO Fengliu, XIONG Rui, LIU Xiaohui, et al. Application of PCR technique for the detection of meat source components[J].Journal of Food Safety&Quality,2014,5(2):541-545.
[11] ZHAO L J,HUA M Z,LI S M,et al.Identification of donkey meat in foods using species-specific PCR combined with lateral flow immunoassay[J].RSC Advances,2019,9(46):26552-26558.
[12] 史莹莹,康雨薇,邵俊锋,等.实时荧光定量PCR 鉴定肉制品中牛源性成分及其含量[J].食品研究与开发,2020,41(6):158-163.SHI Yingying,KANG Yuwei,SHAO Junfeng,et al.Identification of bovine derived components and contents in products by real-time fluorescent quantitative PCR[J]. Food Research and Development,2020,41(6):158-163.
[13] 罗建兴,海小,刘国强,等.利用实时荧光定量PCR 法检测食品中鹌鹑源性成分[J].食品研究与开发,2019,40(3):177-183.LUO Jianxing,HAI Xiao,LIU Guoqiang,et al.Detection of quail origin in foods by real time quantitative PCR[J].Food Research and Development,2019,40(3):177-183.
[14] 汪艺,冯俊丽,戴志远,等.实时荧光定量聚合酶链式反应快速鉴定三种鳕鱼[J].核农学报,2020(10):2190-2198.WANG Yi,FENG Junli,DAI Zhiyuan,et al.Rapid identification of three cod species by quantitative real-time polymerase chain reaction[J]. Journal of Nuclear Agricultural Sciences, 2020(10): 2190-2198.
[15] 李进波,李想,谌鸿超,等.实时荧光PCR 法鉴定食品中鲑亚科鱼成分[J].食品科学,2013,34(20):194-198.LI Jinbo, LI Xiang, CHEN Hongchao, et al. Identification of salmoninae in foods by real-time PCR[J].Food Science,2013,34(20):194-198.
[16] 陈涛,史妍茹,尤平.麦穗鱼线粒体基因组序列测定及分析[J].动物分类学报,2012,37(1):10-19.CHEN Tao,SHI Yanru,YOU Ping.Sequence and analysis of complete mitochondrial genome of Pseudorasbora parva[J].Acta Zootaxonomica Sinica,2012,37(1):10-19.
[17] HORREO J L,FITZE P S,JIMENEZ-VALVERDE A,et al.Amplification of 16S rDNA reveals important fish mislabeling in Madrid restaurants[J].Food Control,2019,96:146-150.
[18] 郭元顺,王树峰,李生瑄,等.4 种鲤科鱼类线粒体atp6 基因差异分析[J].甘肃畜牧兽医,2019,49(10):51-55.GUO Yuanshun, WANG Shufeng, LI Shengxuan, et al. Mitochondrial ATP6 gene difference analysis of 4 species of cyprinid fish[J].Gansu Animal and Veterinary Sciences,2019,49(10):51-55.
[19] 周传江,马爱喆,汪曦,等.鱼类线粒体基因组研究进展[J].河南师范大学学报(自然科学版),2019,47(2):74-82.ZHOU Chuanjiang,MA Aizhe,WANG Xi,et al.Progress on fish mitochondrial genome[J].Journal of Henan Normal University(Natural Science Edition),2019,47(2):74-82.
[20] HU YX,HUANG SY,HANNNER R,et al.Study of fish products in metro vancouver using DNA barcoding methods reveals fraudulent labeling[J].Food Control,2018,94:38-47.
[21] CLINE E. Marketplace substitution of Atlantic salmon for Pacific salmon in Washington State detected by DNA barcoding [J]. Food Research International,2012,45(1):388-393.
[22] CAWTHORN D-M,STEINMAN H A,WITTHUHN R.C.DNA barcoding reveals a high incidence of fish species misrepresentation and substitution on the South African market[J].Food Research International,2012,46(1):30-40.
[23] WARD R D,ZEMLAK T S,INNES B H,et al.DNA barcoding Australia's fish species[J].Philosophical Transactions of the Royal Society of London Series B, Biological Sciences, 2005, 360(1462):1847-1857.
Application of Real-time PCR in Identification of Rainbow Trout(Oncorhynchus mykiss)Source Components
刘金玉,季超,靳佳瑞,等.实时荧光PCR 在虹鳟源性成分鉴别中的应用[J].食品研究与开发,2021,42(12):177-182.
LIU Jinyu,JI Chao,JIN Jiarui,et al.Application of Real-time PCR in Identification of Rainbow Trout(Oncorhynchus mykiss)Source Components[J].Food Research and Development,2021,42(12):177-182.